Farmakofor

Farmakofor merupakan deskripsi abstrak dari fitur molekul yang penting untuk rekognisi molekul ligan berdasarkan fungsi makromolekul biologisnya. Menurut (IUPAC), framakofor merupakan ensembel fitur sterik dan elektronik yang diperlukan untuk memastikan interaksi supramolekuler interaksi yang optimal dengan struktur biologis target yang spesifik dan untuk memicu atau memblok respon biologisnya. Farmakofor tidak merepresentasikan kondisi nyata molekul atau asosiasi gugus fungsional secara nyata, tetapi merupakan konsep abstrak yang berhubungan dengan kapasitas interaksi molekuler secara umum dari kelompok senyawa berkaitan dengan struktur targetnya. Farmakofor dapat didefinisikan sebagai denominator umum terbesar yang ditunjukan oleh set molekul yang aktif. Definisi ini menghilangkan kesalahan yang sering ditemukan pada literatur kimia medisinal yang mengandung penamaan farmakofor fungsional kimia sederhana seperti guanidin, sulfonamida atau dihidroimidazol (bentuk imidazolin), atau tipikal struktural skeleton seperti flavon, fenotiazin, prostaglandin atau steroid.^[1]

Fitur farmakofor

1. HBA (Hydrogen Bond Acceptor)
2. HBD (Hydrogen Bond Donor)
3. Hidrofobik
4. Cincin Aromatik^[2]

Aplikasi farmakofor

1. LigandScout
2. HipHop
3. Hypogen
4. DISCO
5. GASP^[2]

Referensi

1. ↑ Wermuth, C. G.; Ganellin, C. R.; Lindberg, P.; Mitscher, L. A. (1998-01-01). "Glossary of terms used in medicinal chemistry (IUPAC Recommendations 1998)". Pure and Applied Chemistry (dalam bahasa Inggris). 70 (5). doi:10.1351/pac199870051129. ISSN 1365-3075. Diarsipkan dari asli tanggal 2018-04-02. Diakses tanggal 2017-09-23.
2. 1 2 Yang, Sheng-Yong. "Pharmacophore modeling and applications in drug discovery: challenges and recent advances". Drug Discovery Today. 15 (11–12): 444–450. doi:10.1016/j.drudis.2010.03.013. Diarsipkan dari asli tanggal 2023-05-23. Diakses tanggal 2017-09-23.