Disekitar Museum Sejarah Purbakala Pleret terdapat beberapa situs peninggalan sejarah lainnya.
Ada situs Kerto peninggalan Sultan Agung Hanyokrokusumo
Situs ini berupa tinggalan struktur batu bata merah dan umpak batu.
Situs Masjid Agung Pleret merupakan tinggalan berupa tempat beribadah pada masa itu.
Masjid ini berada disebelah Utara Museum Sejarah Purbakala Pleret.
Situs benteng ini ditemukan disebelah timur Museum Sejarah Purbakala Pleret
Benteng ini berfungsi sebagai tembok perlindungan terhadap serangan musuh dari luar.
Kemudian ada situs Gunung Kelir yang terletak di sebelah timur
Situs tersebut merupakan kompleks pemakaman
Tokoh yang dimakamkan disitu adalah Ratu Malang, Ki Dalang Panjang Mas, dan lainnya
