Sepeninggal Johannes, ia dihargai pemerintah Indonesia dengan Bintang Mahaputera Utama. Sosoknya diabadikan sebagai nama suatu jembatan di Jakarta beserta jalan di Ambon dan Jakarta. KM Johannes Latuharhary, kapal kargo yang dibangun di Polandia, juga dinamakan atasnya. Ada pula yayasan "Mr J. Latuharhary Foundation" yang merupakan penerbit surat kabar Sinar Harapan di Ambon.
Rijksvoorlichtingsdienst (RVD)