Museum Wayang Indonesia adalah museum khusus yang mengoleksi wayang dari berbagai daerah di Jawa Tengah, Jawa Barat dan Bali.
Lokasi museum berada di Jalan Raya Wuryantoro, Ngebel, Kecamatan Wuryantoro, Kabupaten Wonogiri, Jawa Tengah.
Museum ini didirikan oleh Bupati Wonogiri bernama Begug Poernomosidi. Peresmian museum diadakan pada tahun 2004 oleh Megawati. Kepemilikan museum diserahkan kepada Pemerintah Kabupaten Wonogiri, sedangkan pengelolaannya kepada Dinas Pendidikan Kabupaten Wonogiri.
Jumlah koleksi di museum ini sekitar 200 wayang.
Jenis wayang yang dikoleksi meliputi Wayang Kulit Purwa, Wayang Golek, Wayang Bali, Wayang Klitik, Wayang Suket, Wayang Beber, Topeng, dan Bakalan Wayang.
Selain wayang, museum ini juga mengoleksi lukisan semaryang berukuran 3 × 3 cm buatan Ki Djoko Sutedjo.
Akses ke museum dapat dari Bandar Udara Adi Sumarmo (63 km), Stasiun Wonogiri (16 km), atau Terminal Giri Adipura (21 km).
